整个生产工艺中有机肥发酵是相当重要的，有机肥的品质也是很大的取决于发酵工艺，所以有机肥发酵工艺我们由其重视。有机肥设备在出产有机肥发酵时升温时刻指堆肥进程的前期，堆肥温度升逐渐从环境度温上升到45℃，主导微生物以嗜温性微生物为主，包含细菌、真菌和放线菌，分化底物以糖类和淀粉类为主，时刻能发现真菌的子实体，也有动物及原生动物参加分化。

有机肥发酵高温时刻堆稳升至45℃以上即进入高温时刻，在这一时刻，嗜温微生物遭到克制乃至去世，而嗜热微生物则上升为主导微生物。有机肥造粒机在造粒前在堆肥中残留的和新构成的可溶性有机物质继续被氧化分化，凌乱的有机物如半纤维素-纤维素和蛋白质也初步被剧烈分化。

有机肥发酵的微生物活动替换出现，一般在60℃的时分较剧烈的是嗜热性真菌和放线菌，温度上升到70℃时真菌简直完全间断活动，仅有嗜热性细菌和放线菌活动，温度上升到80℃时大多数嗜热性微生物已不再习惯，并大批进入休眠和去世时刻，现代化有机肥出产线对堆肥出产的较佳温度一般为60℃,因为大多数微生物在该温度范围内较活泼，较易分化有机物，而病原菌和寄生虫大多数可被杀死。

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